Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 POLR1C-209ENST00000512472 569 ntTSL 221.81■■□□□ 1.082e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 VPS26A-209ENST00000497564 462 ntTSL 521.48■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-217ENST00000450491 686 ntTSL 321.38■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 12e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MARK3-209ENST00000555235 2282 ntTSL 221.24■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 VPS26A-205ENST00000489656 817 ntTSL 521.17■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.922e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 POLR1C-204ENST00000423780 418 ntTSL 520.52■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-214ENST00000440732 592 ntTSL 420.51■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.822e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-213ENST00000437283 777 ntTSL 1 (best)19.86■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 VPS26A-204ENST00000467852 666 ntTSL 319.66■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 POLR1C-206ENST00000455605 1882 ntTSL 519.6■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 NDUFS4-203ENST00000506765 559 ntTSL 219.03■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-207ENST00000392263 1630 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.62■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 ATE1-204ENST00000423243 2031 ntTSL 1 (best)17.14■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MARK3-226ENST00000561314 724 ntTSL 316.88■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 EP400-208ENST00000611841 3129 ntTSL 515.61■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 NDUFS4-201ENST00000296684 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 NDUFS4-204ENST00000506974 833 ntTSL 1 (best)15.12■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MARK3-211ENST00000556744 1051 ntTSL 1 (best)14.96□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 NDUFS4-202ENST00000502423 562 ntTSL 514.96□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 NDUFS4-205ENST00000507026 680 ntTSL 314.58□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MARK3-208ENST00000554627 1571 ntTSL 214.54□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CLASP2-209ENST00000468888 6978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-201ENST00000264274 2540 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MARK3-207ENST00000553942 2298 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MARK3-203ENST00000335102 2331 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MIR4435-2HG-205ENST00000431385 843 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-204ENST00000339403 1723 ntTSL 1 (best)12.31□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-208ENST00000392266 1283 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MED13L-203ENST00000548743 568 ntTSL 312.05□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-205ENST00000358485 2930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MARK3-215ENST00000558787 758 ntTSL 211.25□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MARK3-223ENST00000561071 746 ntTSL 311.25□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 POLR1C-208ENST00000488601 973 ntTSL 211.09□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MARK3-210ENST00000556463 3584 ntTSL 1 (best)10.92□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.092e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-216ENST00000447616 707 ntTSL 58.25□□□□□ -1.092e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-219ENST00000490412 230 ntTSL 1 (best)5.49□□□□□ -1.532e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-209ENST00000413726 658 ntTSL 55.49□□□□□ -1.532e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 POLR1C-205ENST00000428025 576 ntTSL 43.09□□□□□ -1.912e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.922e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 HDLBP-232ENST00000470482 624 ntTSL 218.86■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 HK1-205ENST00000436817 1042 ntTSL 523.32■■□□□ 1.321e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 HK1-212ENST00000480047 575 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 HK1-202ENST00000359426 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 HK1-201ENST00000298649 3596 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 HK1-213ENST00000483054 592 ntTSL 311.82□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 HK1-204ENST00000421088 707 ntTSL 510.75□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 HK1-216ENST00000493591 916 ntTSL 58.7□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 HK1-214ENST00000483077 750 ntTSL 38.56□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 HK1-210ENST00000476368 605 ntTSL 38.35□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 HK1-207ENST00000450646 739 ntTSL 57.17□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 HK1-208ENST00000464803 450 ntTSL 1 (best)4.74□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 PAFAH1B1-210ENST00000575477 694 ntTSL 527.74■■■□□ 2.034e-7■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 PAFAH1B1-211ENST00000576586 557 ntTSL 426.55■■□□□ 1.844e-7■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 PAFAH1B1-203ENST00000570400 661 ntTSL 322.04■■□□□ 1.124e-7■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 PAFAH1B1-204ENST00000571289 589 ntTSL 219.84■□□□□ 0.774e-7■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.774e-7■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 PAFAH1B1-209ENST00000574816 662 ntTSL 59.09□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 PAFAH1B1-206ENST00000572915 1361 ntTSL 1 (best)5.64□□□□□ -1.514e-7■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 NFATC3-209ENST00000561714 792 ntTSL 337.02■■■■□ 3.521e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 NFATC3-219ENST00000568466 737 ntTSL 234.14■■■■□ 3.061e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 NFATC3-210ENST00000562171 707 ntTSL 333.45■■■□□ 2.951e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 NFATC3-206ENST00000539828 2484 ntTSL 223.71■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 NFATC3-217ENST00000566893 715 ntTSL 218.79■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 NFATC3-208ENST00000553077 3870 ntTSL 213.7□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 NFATC3-204ENST00000379165 3583 ntTSL 212.77□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 NFATC3-207ENST00000549350 3588 ntTSL 29.56□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 PPP6R3-216ENST00000529172 500 ntTSL 24.58□□□□□ -1.688e-7■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 PPP6R3-222ENST00000531244 687 ntTSL 54.29□□□□□ -1.728e-7■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 FOXP1-203ENST00000327590 5685 ntTSL 29.3□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 FANCA-210ENST00000563318 605 ntTSL 519.39■□□□□ 0.692e-11■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 URI1-209ENST00000574666 844 ntTSL 536.66■■■■□ 3.462e-7■■■■■ 29.1
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 219 ms