Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms