Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms