Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCAR3P49019 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCAR3P49019 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms