Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDH1P40925 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH1P40925 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH1P40925 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH1P40925 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH1P40925 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH1P40925 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH1P40925 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH1P40925 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH1P40925 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH1P40925 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH1P40925 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH1P40925 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH1P40925 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH1P40925 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH1P40925 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH1P40925 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH1P40925 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH1P40925 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH1P40925 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH1P40925 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH1P40925 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH1P40925 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH1P40925 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MDH1P40925 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDH1P40925 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDH1P40925 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MDH1P40925 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDH1P40925 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDH1P40925 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDH1P40925 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH1P40925 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH1P40925 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH1P40925 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH1P40925 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH1P40925 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH1P40925 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH1P40925 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH1P40925 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH1P40925 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH1P40925 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH1P40925 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH1P40925 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH1P40925 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH1P40925 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH1P40925 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH1P40925 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH1P40925 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH1P40925 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH1P40925 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH1P40925 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH1P40925 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH1P40925 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH1P40925 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH1P40925 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH1P40925 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH1P40925 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH1P40925 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH1P40925 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH1P40925 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH1P40925 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH1P40925 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH1P40925 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH1P40925 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH1P40925 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDH1P40925 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDH1P40925 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDH1P40925 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDH1P40925 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms