Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms