Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms