Protein–RNA interactions for Protein: P01588

EPO, Erythropoietin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOP01588 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPOP01588 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPOP01588 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPOP01588 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPOP01588 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPOP01588 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPOP01588 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPOP01588 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPOP01588 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPOP01588 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPOP01588 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPOP01588 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPOP01588 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPOP01588 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPOP01588 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPOP01588 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPOP01588 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPOP01588 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPOP01588 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPOP01588 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPOP01588 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPOP01588 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPOP01588 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPOP01588 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPOP01588 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPOP01588 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPOP01588 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPOP01588 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPOP01588 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPOP01588 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPOP01588 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPOP01588 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPOP01588 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPOP01588 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPOP01588 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPOP01588 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPOP01588 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPOP01588 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPOP01588 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
EPOP01588 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOP01588 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOP01588 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOP01588 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOP01588 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOP01588 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOP01588 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOP01588 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOP01588 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOP01588 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOP01588 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOP01588 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOP01588 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOP01588 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOP01588 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms