Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP4O95707 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP4O95707 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP4O95707 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP4O95707 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP4O95707 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP4O95707 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP4O95707 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP4O95707 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP4O95707 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP4O95707 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP4O95707 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP4O95707 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP4O95707 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP4O95707 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP4O95707 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP4O95707 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP4O95707 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POP4O95707 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POP4O95707 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POP4O95707 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP4O95707 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP4O95707 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP4O95707 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POP4O95707 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POP4O95707 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP4O95707 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP4O95707 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP4O95707 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP4O95707 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP4O95707 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP4O95707 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP4O95707 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP4O95707 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP4O95707 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP4O95707 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP4O95707 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP4O95707 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP4O95707 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP4O95707 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP4O95707 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP4O95707 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP4O95707 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP4O95707 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP4O95707 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP4O95707 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP4O95707 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP4O95707 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP4O95707 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP4O95707 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP4O95707 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP4O95707 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP4O95707 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POP4O95707 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP4O95707 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP4O95707 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP4O95707 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP4O95707 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP4O95707 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP4O95707 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP4O95707 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms