Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D2O95562 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms