Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP12O75317 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP12O75317 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP12O75317 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP12O75317 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP12O75317 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP12O75317 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP12O75317 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP12O75317 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP12O75317 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP12O75317 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP12O75317 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP12O75317 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP12O75317 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP12O75317 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP12O75317 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP12O75317 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP12O75317 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP12O75317 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP12O75317 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP12O75317 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP12O75317 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP12O75317 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP12O75317 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP12O75317 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP12O75317 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP12O75317 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP12O75317 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP12O75317 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP12O75317 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP12O75317 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP12O75317 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP12O75317 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP12O75317 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP12O75317 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP12O75317 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP12O75317 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP12O75317 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP12O75317 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP12O75317 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP12O75317 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP12O75317 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP12O75317 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP12O75317 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP12O75317 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP12O75317 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP12O75317 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP12O75317 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP12O75317 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP12O75317 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP12O75317 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP12O75317 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP12O75317 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP12O75317 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP12O75317 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP12O75317 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP12O75317 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP12O75317 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP12O75317 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP12O75317 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP12O75317 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP12O75317 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP12O75317 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP12O75317 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP12O75317 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP12O75317 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP12O75317 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP12O75317 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP12O75317 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP12O75317 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms