Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms