Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID2O43424 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRID2O43424 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRID2O43424 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRID2O43424 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRID2O43424 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRID2O43424 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRID2O43424 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRID2O43424 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRID2O43424 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRID2O43424 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRID2O43424 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRID2O43424 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRID2O43424 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRID2O43424 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRID2O43424 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRID2O43424 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRID2O43424 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRID2O43424 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRID2O43424 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRID2O43424 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRID2O43424 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRID2O43424 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRID2O43424 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRID2O43424 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRID2O43424 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRID2O43424 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRID2O43424 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRID2O43424 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRID2O43424 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRID2O43424 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRID2O43424 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GRID2O43424 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRID2O43424 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRID2O43424 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRID2O43424 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRID2O43424 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRID2O43424 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRID2O43424 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRID2O43424 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRID2O43424 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRID2O43424 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRID2O43424 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRID2O43424 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRID2O43424 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRID2O43424 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRID2O43424 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRID2O43424 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRID2O43424 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GRID2O43424 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms