Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI1O43347 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI1O43347 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI1O43347 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI1O43347 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI1O43347 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI1O43347 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI1O43347 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI1O43347 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI1O43347 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI1O43347 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI1O43347 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI1O43347 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI1O43347 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI1O43347 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI1O43347 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI1O43347 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI1O43347 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI1O43347 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI1O43347 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI1O43347 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI1O43347 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI1O43347 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI1O43347 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI1O43347 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI1O43347 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI1O43347 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI1O43347 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI1O43347 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI1O43347 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI1O43347 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI1O43347 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI1O43347 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI1O43347 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI1O43347 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI1O43347 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI1O43347 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI1O43347 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSI1O43347 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSI1O43347 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSI1O43347 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSI1O43347 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSI1O43347 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MSI1O43347 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSI1O43347 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSI1O43347 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSI1O43347 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSI1O43347 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSI1O43347 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSI1O43347 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSI1O43347 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSI1O43347 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI1O43347 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSI1O43347 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSI1O43347 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSI1O43347 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSI1O43347 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSI1O43347 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSI1O43347 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSI1O43347 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSI1O43347 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSI1O43347 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI1O43347 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI1O43347 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI1O43347 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI1O43347 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI1O43347 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI1O43347 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms