Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTIFO43310 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTIFO43310 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTIFO43310 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTIFO43310 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTIFO43310 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTIFO43310 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTIFO43310 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTIFO43310 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTIFO43310 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTIFO43310 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTIFO43310 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTIFO43310 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTIFO43310 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTIFO43310 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTIFO43310 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTIFO43310 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTIFO43310 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTIFO43310 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTIFO43310 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTIFO43310 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTIFO43310 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTIFO43310 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTIFO43310 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTIFO43310 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTIFO43310 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTIFO43310 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTIFO43310 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTIFO43310 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTIFO43310 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTIFO43310 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTIFO43310 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTIFO43310 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTIFO43310 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTIFO43310 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTIFO43310 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTIFO43310 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTIFO43310 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTIFO43310 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTIFO43310 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTIFO43310 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTIFO43310 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTIFO43310 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTIFO43310 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTIFO43310 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTIFO43310 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTIFO43310 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTIFO43310 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTIFO43310 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTIFO43310 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTIFO43310 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTIFO43310 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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