Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN9O14815 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms