Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM38O00635 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms