Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQF6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQF6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQF6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQF6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQF6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQF6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQF6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQF6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQF6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQF6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQF6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQF6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQF6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQF6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQF6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQF6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQF6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQF6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQF6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQF6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQF6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQF6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQF6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQF6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQF6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQF6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQF6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQF6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQF6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQF6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQF6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQF6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQF6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQF6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQF6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQF6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQF6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQF6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQF6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQF6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQF6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQF6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQF6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQF6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms