Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms