Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN8A6NHC0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN8A6NHC0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN8A6NHC0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN8A6NHC0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN8A6NHC0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN8A6NHC0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN8A6NHC0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN8A6NHC0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms