Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms