Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms