Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms