Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PPP1R26P5-201ENST00000416640 3664 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RDH16-202ENST00000398138 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ABCF2-201ENST00000222388 2185 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 EPB41L4A-201ENST00000261486 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TRIM31-210ENST00000376734 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 COQ5-201ENST00000288532 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC134682.1-201ENST00000569285 3377 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TSGA10-201ENST00000355053 3037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC133919.3-201ENST00000621407 1804 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC026904.1-201ENST00000430626 3549 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC007598.3-201ENST00000623077 1678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms