Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 DDX11L2-201ENST00000437401 1398 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MYT1-202ENST00000360149 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 HS6ST2-202ENST00000370836 4441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CPSF4-206ENST00000441580 942 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ITGAL-203ENST00000433423 1416 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PCDHGA2-202ENST00000528330 4543 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms