Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PPP4R1L-201ENST00000244070 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CA6-203ENST00000377443 1319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CNTF-201ENST00000361987 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 GOLGA8Q-201ENST00000562783 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SEPT4-203ENST00000393086 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC245297.1-201ENST00000313342 933 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC005838.1-201ENST00000430712 233 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC004112.1-201ENST00000431064 561 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC007255.1-202ENST00000447171 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 GUSBP3-202ENST00000513408 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC027237.4-201ENST00000560870 694 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AP000894.2-203ENST00000580612 439 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC112236.2-201ENST00000608402 845 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC242988.1-201ENST00000611044 714 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TMLHE-201ENST00000334398 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 RPL15-202ENST00000354811 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC011472.2-201ENST00000586356 655 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CHEK1-203ENST00000428830 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SC5D-208ENST00000534230 1861 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 UPF3B-204ENST00000619445 1385 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SERTAD3-202ENST00000392028 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CCDC70-201ENST00000242819 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 IL32-204ENST00000396887 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC019349.1-201ENST00000411759 476 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 MTND6P14-201ENST00000433044 522 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 INO80C-203ENST00000441607 904 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms