Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GCAP28676 THEMIS3P-201ENST00000416112 1586 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GCAP28676 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCAP28676 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCAP28676 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCAP28676 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCAP28676 AL132656.4-201ENST00000623504 2122 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GCAP28676 HOPX-211ENST00000554144 1672 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
GCAP28676 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GCAP28676 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GCAP28676 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
GCAP28676 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 LINC00840-201ENST00000431737 1974 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 VAV1-202ENST00000539284 2627 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 GRAMD1B-203ENST00000456860 2805 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 RAI2-202ENST00000360011 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 C16orf78-201ENST00000299191 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 MIR4527HG-201ENST00000586905 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC020897.1-201ENST00000587702 561 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC068669.1-201ENST00000623793 2228 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 AL157838.1-201ENST00000424252 2502 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 ATCAY-205ENST00000600960 2904 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 PMEL-215ENST00000550464 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 FMO3-201ENST00000367755 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 LONP2-203ENST00000535754 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCAP28676 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 FAM86C2P-205ENST00000531806 1814 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 LRSAM1-202ENST00000323301 3376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 ZWINT-203ENST00000373944 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 RPL13AP17-204ENST00000450028 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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