Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP20Q9Y6A4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP20Q9Y6A4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms