Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPRKBQ9Y3C4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms