Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC5Q9UQL6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms