Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-11Q9UQG0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms