Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF490Q9ULM2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms