Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms