Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKP3

ITGB1BP2, Integrin beta-1-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1BP2Q9UKP3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGB1BP2Q9UKP3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB1BP2Q9UKP3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms