Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACFD1Q9UGQ2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACFD1Q9UGQ2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms