Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPASTQ9UBP0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms