Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS18Q9P253 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS18Q9P253 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS18Q9P253 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS18Q9P253 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS18Q9P253 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS18Q9P253 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS18Q9P253 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS18Q9P253 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS18Q9P253 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS18Q9P253 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS18Q9P253 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS18Q9P253 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS18Q9P253 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS18Q9P253 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS18Q9P253 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS18Q9P253 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms