Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDFIP2Q9NV92 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDFIP2Q9NV92 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms