Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms