Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFGAP3Q9NP61 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFGAP3Q9NP61 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms