Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC24A3Q9HC58 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms