Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC86Q9H6F5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC86Q9H6F5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms