Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms