Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NACA2Q9H009 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NACA2Q9H009 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms