Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms