Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms