Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms