Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC138Q96M89 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms