Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms