Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM52Q96A61 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRIM52Q96A61 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM52Q96A61 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM52Q96A61 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM52Q96A61 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM52Q96A61 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM52Q96A61 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM52Q96A61 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM52Q96A61 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM52Q96A61 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM52Q96A61 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM52Q96A61 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRIM52Q96A61 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRIM52Q96A61 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRIM52Q96A61 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRIM52Q96A61 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms